用途：这是 AminoAnalytica 的 Amina CLI 基础技能（foundation skill），用于在会话开始或对话压缩后，开展自主蛋白质工程工作流。技能本身采用渐进式披露（progressive disclosure），按上下文加载参考文档。
参考加载规则：会话开始或首个蛋白质工程请求时，读取 references/setup.md 完成会话初始化，并读取 references/usage.md 加载本会话的执行指导。会话中途需要回忆 CLI 用法、执行模式或 agent 行为时，只读 references/usage.md。遇到环境问题或认证问题时，读取 references/setup.md。
主要能力与常用命令：amina tools list 列出全部工具；amina run <tool> --help 查看参数；amina run <tool> [params] -o <dir> 同步执行；amina run <tool> --background --job-name <n> 异步执行；amina jobs cancel <id> 取消任务（全额退款）；amina jobs wait <id> && amina jobs download <id> -o ./ 等待并下载结果。
关键原则：自动运行命令，端到端完成工作流，不询问不必要的问题。
限制：资料未提供具体可用工具清单、参数含义、认证方式、平台支持范围与定价信息，暂未提供；实际使用需以官方文档 CLI 与 Tools 页面为准。