用途：针对给定靶点蛋白结构，设计全新的蛋白质结合体（binder）。技能按阶段串起完整流程，从清理输入 PDB 到输出经验证的设计。
主要能力：Phase 0 清理并验证靶点 PDB，提取链与序列信息；Phase 1 用 PeSTo 预测结合界面残基，可选糖基化过滤，再用 DBSCAN 聚类并选出热点残基；Phase 1.5 根据表位几何计算建议结合体长度；Phase 2 用 RFdiffusion 生成候选骨架；Phase 3 用 ProteinMPNN 或 ESM-IF1 进行逆折叠序列设计，并采用温度指数衰减策略；Phase 4 依次做溶解度、Boltz-2 结构预测、pLDDT/iPTM/ipSAE、US-align 与 DockQ 验证，失败即提前终止；Phase 5 根据结果决定进入下一轮、换骨架或收尾。
交互方式：Phase 0 至 1.5 自主运行；进入 Phase 2 前会向用户展示设计计划（靶点信息、所选表位与热点、建议长度、骨架数量及风险），等待批准后继续；Phase 2 至 5 自主执行并按轮次汇报。
适用场景：需要为某个靶点蛋白结构设计新型结合体的研究或工程任务。
限制：资料未说明支持的平台、安装方式、依赖环境及运行成本；参数、阈值分级和指标定义位于 references 目录，需按需加载；所有建议参数均为可调整的推荐值，使用前应结合实际条件确认。