用途：该技能用于以编程方式对接 protocols.io（托管可版本化、可引用的科学协议，每个发布版本获得 10.17504/protocols.io.* 形式的 DOI），支持检索、读取、创建、编辑与发布协议，以及管理评论、工作区、文件和实验运行记录。
主要能力：按关键词、作者或工作区搜索协议，或用 DOI/URI 解析协议；以 Markdown、HTML 或 Draft.js JSON 读取协议步骤与材料；创建私有协议、填写元数据与步骤并发布或预留 DOI；读写协议评论与步骤讨论；列出或加入工作区、搜索工作区文件、上传文件、导出机构内容；创建和更新实验运行记录。
使用方式：提供两条途径。官方 MCP 服务器为 https://www.protocols.io/mcp（Streamable HTTP，OAuth 2.0 登录或 Bearer 客户端令牌），若会话中已连接应优先使用。REST API 基址为 https://www.protocols.io/api，多数端点为 v3，获取/更新协议、步骤、运行记录、文件管理器搜索与机构导出使用 v4，参考文档见 https://apidoc.protocols.io/。请求需带 Authorization: Bearer <token>，令牌存于环境变量（如 PROTOCOLS_IO_TOKEN）。协议端点接受整数 id、uri 或 DOI，可加 /v1 指定版本或 /latest 取最新；v4 读取可用 content_format=json|html|markdown；列表端点用 page_id 与 page_size（1–100，默认 10）。响应体含 status_code，0 表示成功，需检查该字段而非仅看 HTTP 状态。
限制：速率限制为每用户每分钟 100 次请求，PDF 端点登录 5 次/分钟、未登录 3 次/分钟，超限返回 HTTP 429。OAuth 令牌约一年有效，到期前一个月警告，刷新会使旧令牌对失效。发布需标题和至少一位作者，已获 DOI 的版本不可再编辑，内容变更需在网页编辑器创建新版本。上传文件为三步（注册、S3 上传、确认），文档未提供文件夹、工作区或标签字段。引用时应注明所用版本 DOI 与检索日期。
适用场景：检索并分析现有协议、起草并发布实验室协议、记录协议运行、团队工作区协作、机构内容归档。不适用于通用电子实验记录、液体处理脚本生成、预印本投递或论文方法部分写作。