用途：在药物发现流程中对化合物库做分子过滤与优先级排序，应用药物化学规则、结构警报、化学基团检测和复杂度指标。规则与过滤器是情境化指南，不是绝对真理，需结合领域知识。
主要能力：medchem.rules 提供单规则函数（rule_of_five、rule_of_veber、rule_of_cns 等）与 RuleFilters 批量过滤，返回含 pass_all、pass_any 及每条规则布尔列的 DataFrame；medchem.structural 提供 CommonAlertsFilters（ChEMBL、PAINS 等警报集）与 NIBRFilters；medchem.functional 提供返回 NumPy 布尔数组的一次性助手（rules_filter、alert_filter、nibr_filter、complexity_filter、chemical_group_filter、lilly_demerit_filter）；medchem.groups 检测策展基团目录（如 hinge_binders）；medchem.complexity 提供 bertz、whitlock、barone、smcm、twc 等复杂度指标及 SPS；medchem.query 提供布尔查询 DSL（MATCHRULE、HASPROP、HASALERT、HASGROUP 等）。
使用方式：安装 uv pip install medchem（会拉取 rdkit 与 datamol）。过滤器接收 SMILES 或 RDKit mol 序列，默认 n_jobs=-1，支持 progress=True。Lilly demerits 需额外原生依赖，用 medchem install-lilly 下载并构建，需要 make、C++ 编译器、zlib，原生 Windows 不支持（用 WSL），缺失时抛 ImportError。ChemAxon 规则需授权安装。
适用场景：化合物库初筛、先导优化过滤、特定化学基团识别、化合物质量评估。
限制：无 rule_of_drug、golden_triangle 等函数；PAINS 属于警报系统；约束对象 Constraints 用于子结构约束而非理化性质窗口；查询 DSL 为结构化语法，非自由文本；上市药物常不满足标准过滤器，应作为指南使用。