用途：面向癌症基因组学分析，通过 cBioPortal 公开 REST API（无需 API key）检索 TCGA、AACR Project GENIE、MSK-IMPACT 等数百项研究的数据，涵盖突变、拷贝数变异（CNA）、结构变异、mRNA/蛋白表达、甲基化与临床数据。
主要能力：浏览研究列表（GET /studies）；查询研究的分子谱（GET /studies/{studyId}/molecular-profiles）；获取突变数据（POST /molecular-profiles/{profileId}/mutations/fetch）；获取离散拷贝数 GISTIC 值 -2 至 2（POST /molecular-profiles/{profileId}/discrete-copy-number/fetch）；获取表达数据；获取临床属性与临床数据；用 POST /genes/fetch?geneIdType=HUGO_GENE_SYMBOL 把基因符号转 Entrez ID。可据此计算突变频率、做泛癌比较与按突变状态拆分生存数据。
使用方式：直接用 requests 调用 https://www.cbioportal.org/api，GET/POST 均需 JSON 头；基因符号查询须带 geneIdType 参数且请求体为纯 JSON 数组，如 ["TP53"]，否则返回 400 或空数组；响应顺序不保证，需按 hugoGeneSymbol 回映射。临床数据全局接口 /clinical-data/fetch 仅 POST，GET 返回 405；单研究可用 GET /studies/{studyId}/clinical-data，每次只接受一个 attributeId。OS_STATUS/DFS_STATUS 编码为 "1:DECEASED"/"0:LIVING"，需拆分事件标志。计算频率时建议用 all_cases_with_mutation_data 样本列表作分母，且分子分母按样本而非患者计数。大规模分析可下载数据文件，例如 wget https://datahub.assets.cbioportal.org/brca_tcga_pan_can_atlas_2018.tar.gz（旧 cbioportal-datahub.s3.amazonaws.com 链接已 403）。
适用场景：突变图谱、癌基因/抑癌基因验证、共突变模式、生存分析、改变类型谱、泛癌分析、临床关联与 TCGA/GENIE 数据探索。
限制：不用于胚系变异致病性（对应 alterlab-clinvar）、COSMIC 突变签名、DepMap 基因依赖性、OpenTargets 靶点证据。GENIE 联盟正式发布数据在需登录的独立门户，不在无密钥公共 API。部分研究可能缺少某些分子谱，批量查询需加延时。具体收费、价格与运行环境暂未提供。