用途：通过 Python 脚本调用无需密钥的 bioRxiv API，检索与获取生命科学预印本，适合查找特定研究方向的近期预印本、跟踪某位作者的预印本、做预印本系统综述或趋势分析、整理引用元数据、下载 PDF 进行分析，以及按 bioRxiv 学科分类筛选论文。需要同行评审且经 MeSH 索引的期刊文献应改用 alterlab-pubmed；计算机、物理、数学等预印本用 alterlab-arxiv；预印本引用量等跨出版商计量指标用 alterlab-openalex；自己投递预印本用 alterlab-preprint-deposition；多库 PRISMA 系统综述用 alterlab-literature-review。
主要能力：脚本仅依赖 requests，可用 uv 按需安装依赖运行：uv run --with requests scripts/biorxiv_search.py --help。支持关键词搜索（对标题/摘要做大小写不敏感子串匹配，多个关键词为 OR 语义，可用 --search-fields 限定字段）、作者搜索（对作者列表做子串匹配）、日期范围搜索（--start-date/--end-date 或 --days-back）、按 DOI 获取详情，以及 --download-pdf 下载全文 PDF。还提供 BioRxivSearcher 类供 Python API 调用，包含 search_by_keywords、search_by_author、search_by_date_range、get_paper_details、download_pdf、format_result 等方法。搜索结果输出结构化 JSON，含 doi、title、authors、date、version、type、license、category、abstract、pdf_url、html_url 等字段；学科分类可传 --category，例如 genomics、neuroscience、cell-biology 等。
用法与要点：/details 端点按日期范围返回预印本，每页 30 条，支持服务端 ?category= 过滤，但没有关键词和作者过滤，因此关键词与作者筛选在客户端完成，会先分页取回整个日期范围再过滤。日期范围越窄越好，已知学科时务必加 --category 可同时减少结果量和 API 调用；--limit 对纯日期范围搜索能提前停止分页，对关键词/作者搜索只裁剪最终列表。脚本请求间隔 0.5 秒，无官方硬性速率限制，大批量时应增加延时并把结果缓存为 JSON。bioRxiv DOI 有两种前缀：较早预印本为 10.1101/…，2025 年 12 月迁至 openRxiv 后为 10.64898/…，脚本会统一规范化 DOI、doi.org 链接和 content URL。
限制：仅覆盖生物学主题；同一 API 也服务 medRxiv，需在端点路径中把 biorxiv 换成 medrxiv（如 /details/medrxiv/2025-03-21/2025-03-28?category=cardiovascular%20medicine），但随附脚本面向 bioRxiv，查询 medRxiv 需直接用 curl/requests。PDF 来自 www.biorxiv.org，位于 Cloudflare 之后，脚本化请求可能返回 HTTP 429，应拉开下载间隔或改用 html_url；批量全文可考虑 bioRxiv 的 requester-pays 文本挖掘存储桶 s3://biorxiv-src-monthly（MECA zip 包，见 https://www.biorxiv.org/tdm）。DOI 查询返回最新版本，下载 PDF 默认解析最新版本，可用 version= 覆盖。结果为空的常见原因是日期范围内无匹配论文、分类过窄或临时 API 连接问题；可用 --verbose 查看分页请求与总数。其他价格、平台等信息暂未提供。