用途：从差异表达基因（DEG）分析结果生成火山图（volcano plot）的 R/Python 代码，用于展示基因表达数据中统计显著性（p 值）与变化幅度（倍数变化）的关系，适合生物信息学分析与论文插图。触发场景包括 RNA-seq DEG 结果可视化、p 值与 fold-change 散点图、寻找显著上调/下调基因、标注目标基因、多条件比较等。
主要能力：提供打包的可执行入口 scripts/main.py，可按参数生成可定制的 R 或 Python 脚本及发表级图表（PNG/PDF/SVG）；支持自定义 log2FC 与 p 值阈值、基因注释与高亮、按颜色区分上调/下调/不显著基因、输出带标签的显著基因列表。参考材料在 references/，可复用资产包括 assets/example_volcano.R。
使用方式：输入需包含基因标识（symbol 或 ENSEMBL ID）、log2 倍数变化值、校正或原始 p 值，可选基因注释与通路信息。常用参数：--input（DEG 结果 CSV/TSV，必填）、--output（默认 volcano_plot.png）、--log2fc-col（默认 log2FoldChange）、--pvalue-col（默认 padj）、--gene-col（默认 gene）、--log2fc-thresh（默认 1.0）、--pvalue-thresh（默认 0.05）、--label-genes、--top-n（默认 10）及上/下/非显著颜色参数。示例：python scripts/main.py --input deg_results.csv --output volcano_plot.png。运行前可用 python -m py_compile scripts/main.py 校验脚本，python scripts/main.py --help 查看帮助。Python 依赖 pandas、matplotlib、seaborn、numpy；R 依赖 ggplot2、dplyr、ggrepel。
适用场景：RNA-seq DEG 可视化、显著基因识别、通路或标记基因标注、论文级图表制作、多实验条件比较。
限制与风险：技术难度中等，需理解 fold change、p 值、FDR 及绘图库；脚本本地执行，涉及代码执行与文件读写风险（中），无外部 API 调用；要求输入路径与输出目录受工作空间限制，输入需校验；当前生命周期为 Draft，已知问题为无，计划增加 Plotly 交互图、多比较组支持与通路富集集成。若输入缺失或任务超出文档范围，应明确指出缺失字段并停止或请求最小补充信息，不臆造文件、引用或执行结果。价格、收费、具体平台与效果数据暂未提供。