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写作与研究

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更新于 10-15 16:45

技能介绍

用途:由用户提供的研究方向(一个暴露或暴露集 + 一个结局)生成完整的双样本孟德尔随机化(MR)研究设计,支持单暴露→单结局、多暴露筛查、双向 MR、生活方式/饮食/行为、生物标志物/分子性状及面向发表的综合设计六种风格。

主要能力:推断研究类型(暴露类别、研究目标、是否需要 MVMR 或共定位、时间与资源限制);始终输出 Lite、Standard、Advanced、Publication+ 四种配置及各自目标、所需数据、模块、工作量、图表、优缺点,并推荐一个主方案;给出分步工作流(GWAS 选择与祖源匹配、工具变量提取 p<5×10⁻⁸、LD clumping r²<0.001/10,000 kb、F 统计量筛选 F>10、回文 SNP 协调、IVW 主分析、MR-Egger/加权中位数/众数、Cochran's Q 与 I²、MR-Egger 截距与 MR-PRESSO、留一法、双向 MR、MVMR、功效/MDES、共定位 PP.H4>0.8);提供图表计划(散点图、森林图、漏斗图、结果与敏感性分析表)和验证分层(主证据、敏感性支持、高阶因果强化);包含风险自查与审稿人常见质疑;给出最小可执行版本与发表升级路径。

使用方式:输入一个暴露(或暴露集)与一个结局即可;细节不足时推断合理默认设计并明确声明假设。R 代码框架以 CRAN 的 TwoSampleMR 包为主,可配合 MRPRESSO,示例:library(TwoSampleMR);extract_instruments(outcomes = "...");harmonise_data();mr();用 available_outcomes() 查询 GWAS ID。

限制:仅覆盖双样本 MR,不处理 RCT、倾向评分匹配、DAG 观察性分析、贝叶斯网络等非 MR 因果推断设计;工具变量少于 3 个时提示 MR 不可行,F<10 时不以 IVW 为主并升级到弱工具稳健方法;不强制双向 MR 或 MVMR;不夸大弱工具或行为表型噪声下的因果结论;用户未提供的时间、价格、平台等事实暂未提供。