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translational-gap-analyzer

写作与研究

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更新于 10-15 16:45

技能介绍

用途:评估基础研究模型与人类疾病之间的“转化差距”,对临床转化失败风险提供早期预警,帮助研究者识别临床前研究中的潜在转化障碍。\n\n主要能力:评估模型与人类的解剖/生理差异;分析疾病模型的病理相似性;识别分子通路的种间差异;评估药代动力学差异;提供临床试验失败风险因素的早期预警;给出提高转化成功率的改进建议。\n\n使用方式:脚本为 scripts/main.py,依赖 Python 3.8+ 及内置库 argparse、json、sys。先校验脚本可解析:python -m py_compile scripts/main.py,再查看帮助:python scripts/main.py --help。示例命令:完整评估报告 python scripts/main.py --model <model_type> --disease <disease_name> --full;快速风险评估 --quick;多模型比较 --models mouse,rat,primate --compare;指定关注领域 --focus metabolism,immune。参数包括 --model(mouse、rat、zebrafish、cell_line、organoid、primate,与 --models 二选一)、--models(逗号分隔多模型比较)、--disease(疾病名或 MeSH ID,必填)、--focus(anatomy、physiology、metabolism、immune、genetics、behavior)、--full、--quick、--compare、--output、--format(json、markdown、table)。输出为结构化结果,含整体差距评分、风险级别、各维度评分与关切点、临床失败预测因素与建议。差距评分 0-3 低、4-6 中、7-8 高、9-10 极高。\n\n适用场景:临床前研究转化风险评估、多模型选择比较、机制研究的转化可行性分析。\n\n限制与风险:代码在本地执行(中等风险),可读写文件但不调用外部网络 API;缺少必需输入时应明确缺失字段并请求最少补充信息;脚本失败时需报告失败点并给出人工回退方案;不得编造文件、引用、数据或执行结果。当前生命周期阶段为 Draft。