用途：将宽泛的疾病、生物标志物、治疗反应、亚型或转化医学想法，转化为可执行的临床—多组学整合研究设计。
主要能力：推断真实临床与转化目标；选择最匹配的研究模式；输出 Lite / Standard / Advanced / Publication+ 四种工作量配置并推荐一个主方案；给出示例数据集方向（仅作候选，不保证可用）；定义临床变量与组学层的对齐、特征降维与融合逻辑；选择具体分析方法；设计分步工作流、验证阶梯与证据层级；规划图表与交付物；在用户要求且可核实时提供文献支持层；最后给出自我批判式风险审查。
使用方式：输入一个或多个疾病/表型加临床变量与两个以上组学层整合需求，或生物标志物、预后、治疗反应、亚型、转化问题，或对齐 EHR 与组学数据的建模问题。可选补充偏好组学层、仅用公开数据、湿实验条件、目标层级、主要目标是关联/预测/分层/机制转化。输出固定按 A–L 分节：研究意图摘要、最佳研究模式、四种配置对比表、推荐主方案、数据策略、核心分析模块与方法、对齐与融合逻辑、分步工作流、验证与证据层级、图表交付计划、文献支持、风险审查。
限制：不提供患者个体诊疗建议；不适用于临床整合并非核心的单组学项目；不编造数据集、登录号、样本量、PMID、DOI、期刊或验证状态；不强行使用复杂融合；不把特征压缩或嵌入当作机制证据；不将治疗后变量当作基线预测因子；转录组差异分析须区分计数数据（默认 DESeq2）与非计数标准化数据（默认 limma）；涉及数据集时须在流程前加数据集免责声明。