用途：把生物医学论文的方法学逆向重构为可复现、可审计的分步工作流，回答研究究竟如何操作执行、哪些步骤明确哪些缺失、现实可复现到什么程度。
主要能力：先判定输入覆盖层级（全文方法、部分方法、仅标题摘要）与研究设计家族（随机对照/干预、队列/病例对照/横断面/注册/真实世界、诊断/预后/预测建模、组学/生物信息/公共数据集、基础实验/机制、临床与计算混合等），再抽提研究目标与主要比较逻辑，按序重建从数据/样本获取到最终验证的操作流程，分离样本定义与分析执行，抽取软件、工具、平台、检测系统及关键参数，识别质控、对照、验证与敏感性逻辑，构建复现清单，标记缺失细节与隐藏假设，并给出复现就绪度结论。
使用方式：输入一份或多份材料，如全文PDF、方法学文本、摘要加标题、DOI/PMID/引文、方法图或流程图截图、部分笔记。技能按固定章节A–K输出：输入覆盖与重建范围、研究设计识别、一句话方法逻辑、方法链快照、数据/样本/入选结构、有序分析或实验流程、工具软件与关键参数、验证与质控路径、复现缺口与隐藏假设、复现清单、复现就绪度判断。流程步骤逐条标注为明确报告、强可推断或缺失未决。
适用场景：需要重建论文实际操作流程、提取组学分析工作流与软件、把方法学转为复现检查清单、判断复现瓶颈与缺失参数的研究者。
限制：不总结论文、不编造缺失参数/样本量/软件版本/方案、不提供患者个体医疗建议、不在报告不足时声称可复现；覆盖不足时只做受限的设计层与流程可能性概述并明确标注；缺失细节一律标为未决，不把“标准方法”当作完整规范。