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写作与研究

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更新于 10-15 16:44

技能介绍

用途:在用户明确要基于 PubMed 证据撰写医学综述、叙述性综述或长篇综述,并接受“大纲—检索—逐章写作—核验—格式化”多阶段流程、需要真实中间文件时使用。仅需摘要、单段综述或简短背景介绍时不适用。

必要输入:topic(必填,主题文本,如 TP53 in lung cancer,缺失须停止并询问);project_dir(必填,本地目录);language(可选,默认中文);target_scope(可选,未提供则按标准长综述执行)。

主要能力与流程:

  1. 大纲构建:规划 3-5 个主章节,必须细化到子标题(### 1.1 等),每个主章节预设 2-4 个子标题,生成 outline.md,确认后进入下一步。
  2. 数据检索与文献库构建:按章节设计检索式,执行 python scripts/pubmed_search.py "QUERY" --section "introduction|section_1|...",--section 须严格对应文件名;脚本批量获取 PMID 详情,约每秒 1 次请求,--max 默认 20;references.json 保存到项目目录;用 python scripts/count_references.py 检查,目标唯一 PMID 至少 150。
  3. 逐章写作:用 python scripts/read_references.py "SectionName" 读取文献,创建 introduction.md 与 section_1.md 等;每章须分 2-4 个子标题,段落完整,客观论断以 [PMID: xxx] 标注;证据不足时用 --post-write 补充检索;完成后用 python scripts/check_section.py "section_1.md" 核验,据状态机处理引用不足、字数不足(< 7000 字符)或引用过密(单句 > 2 条);每章通过后须向用户报告并获确认再继续。修改已格式化文档时先运行 python scripts/revert_citations.py Review_Final_Formatted.md -o draft.md 还原,再补文献并重新格式化。
  4. 撰写 conclusion.md:总结核心发现,呼应引言,展望未来,不含引用。
  5. 摘要与定稿:创建 abstract.md,含标题、Background、Content、Findings、Conclusion,不含引用,5-7 个关键词以中文分号分隔;用 python scripts/merge_review.py abstract.md introduction.md section_1.md ... -o Review_Final.md 合并(不含 outline.md)。
  6. 引用格式化:运行 python scripts/format_citations.py Review_Final.md -o Review_Final_Formatted.md,核查引用链接与参考文献列表。

核心原则:必须创建真实文件而非仅在内存处理;仅用 [PMID: xxx] 中间引用格式;默认中文写作,术语可保留英文;引用仅用于引言与正文,摘要和结论不用;单一文献引用不超过 2 次(最多 3 次)。

限制与失败处理:关键输入缺失须明确说明并暂停;脚本、模板或资源执行失败须报告失败步骤、原因与恢复建议,不得静默降级;仅部分完成时先返回已验证部分,再列出剩余阻塞与建议。请求超出范围或缺少关键输入时,应提示该技能仅处理其文档化工作流,请补充输入或改用其他技能。其他平台、收费、效果等资料暂未提供。