用途：为常规双疾病共享生物标志物论文（基于 bulk 表达数据集）生成结构化、可执行的研究设计，而非文献综述或工具清单。典型论文逻辑涵盖疾病A与对照、疾病B与对照的差异表达，共享信号交集或一致性整合，基于PPI的枢纽基因优先级排序，各疾病诊断评估，共享临床或生物学解释，免疫浸润背景，单基因通路跟进，以及在两种疾病背景下的可选独立验证。
主要能力：推断研究类型并选择研究范式（共享DEG优先、共享枢纽基因优先、混合、免疫背景、正交验证）；输出四档工作量配置，每档含目标、所需数据、主要模块、工作量估计、图表复杂度、优缺点；推荐主方案并说明理由；输出依赖图与证据图、逐步工作流、图表与交付物计划、验证与稳健性、最小可执行版本、发表升级路径、参考文献包及自批判风险评审。
必要用法：输入需为有效的“疾病对 + 共享生物标志物/枢纽基因/通路方向”，可选补充仅用公共数据、无湿实验、单一最终先导基因、免疫角度、单一共享通路、配置级别、目标期刊层级。执行严格按7步顺序：推断研究类型、选择研究范式、输出四档配置、推荐主方案、文献检索层、依赖一致性检查、按固定结构输出完整计划。
限制：不处理临床试验方案、给药、处方、患者个体治疗建议；不处理纯scRNA、纯MR、纯GWAS或纯蛋白质组且无常规bulk转录组共享标志物骨架的研究；不处理仅湿实验、无计算规划框架的请求；不处理单疾病或无共享设计目标的请求；不处理非生物医学或离题请求。仅表达数据集时不得输出蛋白、组织或功能实验结论。无独立验证时须明确两疾病验证的不对称性。不得编造文献引用；无法核验时输出检索策略与证据缺口说明。